[1]赵建涛,尹延旭,常培培,等.番茄SSR-PCR反应体系的优化[J].黑龙江农业科学,2014,(12):15-18.
　ZHAO Jian-tao,YIN Yan-xu,CHANG Pei-pei,et al.Optimization for SSR-PCR Reaction Systemof Tomato by Orthogonal Design[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2014,(12):15-18.
点击复制

番茄SSR-PCR反应体系的优化

《黑龙江农业科学》[ISSN:1002-2767/CN:23-1204/S] 卷: 期数: 2014年12 页码: 15-18 栏目: 出版日期: 2014-12-10
Title:
Optimization for SSR-PCR Reaction Systemof Tomato by Orthogonal Design
文章编号:
1002-2767（2014）12-0015-04
作者:
赵建涛1; 尹延旭1; 常培培1; 胡晓辉1; 张 静1; 2
1.西北农林科技大学 园艺学院，陕西 杨凌 712100；
2.西北农林科技大学 园艺实验教学示范中心，陕西 杨凌 712100
Author(s):
ZHAO Jian-tao1; YIN Yan-xu1; CHANG Pei-pei1; HU Xiao-hui1 ZHANG Jing1; 2
1.College of Horticulture,Northwest Agriculture and Foresty University,Yangling,Shaanxi 712100;
2.Experimental Teaching Model Center of Horticulture,Northwest Agriculture and Foresty University,Yangling,Shaanxi 712100
关键词:
番茄; SSR-PCR反应体系; 2×Taq PCR Master Mix; 正交设计
Keywords:
tomato; SSR-PCR reaction system; 2×Taq PCR Master Mix; orthogonal design
分类号:
S641.2
文献标志码:
A
摘要:
为了确定番茄的SSR-PCR的最佳反应体系，采用2×Taq PCR Master Mix，对Taq酶、Mg2+、dNTPs进行综合考虑，探究其对番茄SSR-PCR反应体系的影响，并优化出最佳的反应体系。结果表明：引物用量对结果影响最大，其次是DNA用量，Mas·er Mix用量对结果影响最小。最佳反应体系为：模板（50 ng·μL-1）DNA2 μL，Master Mix 9 μL，引物3 μL。
Abstract:
In order to determine the best SSR-PCR reaction system for tomato,the effect of Taq DNA polymerase，Mg2+ and dNTPs consideration synthetically by 2×TaqPCR Master Mix was studied,so as to find out the effect and influence on the SSR-PCR reaction system of tomato and optimize the best reaction system.The results showed that the most remarkable factor was primers followed by template DNA,the least one was 2×Taq PCR Master Mix.The optimum reaction system was template DNA（50 ng·μL-1）DNA 2 μL，Master Mix 9 μL，primers 3 μL.

参考文献/References:

[1] 孙亚东，梁燕，吴江敏，等 . 番茄数量性状与番茄红素相关性分析 [J]. 中国蔬菜， 2010 （ 6 ） :74 - 76.

[2]Adriana Sacco,Antonio Di Matteo.Quantitative trait loci pyramiding for fruit quality traits in tomato[J].Molecular Breeding，2013，31:217-222.

[3]Madan Mohan,Suresh Nair.Genome mapping,molecular markers and markers-assisted selection in crop plants[J].Molecular Breeding,1997,3:87-103.

[4]Grandillo,Tanksley S D.Genetic analysis of RFLPs,GATA microsatellites and RAPDs in a cross betweenL.esculentumand L.pimpinellifolium[J].Theor Appl Genet,1996,92:957-965.

[5]Grandillo,S.D.Tanksley.QTL analysis of horticultural traits differentiating the cultivated tomato from the closely relatedLycopersicon pimpinellifolium[J].Theor Appl Genet 1996,92:935-951.

[6]刘阳,陈火英，魏毓棠，等.番茄SSR遗传连锁图谱的构建及几个产量相关QTL的定位[J].自然科学进展，2005,15（6)：748-751.

[7]Saskia Sulaiman-pollatschek,Kualla Kashkushg.Generation and mapping of AFLP,SSRs AND SNPs in Lycopersicon esculentum[J].Cellular and Molecular Biology Letters,2002,7:583-597.

[8]Thomas C M,Vos P,Zabeau M,et al.Identification of amplified restriction fragment length polymorphism markers linked to genes controlling boar sperm viability following cryopreservation[J].Biol Reprod.,2002,66(3):545-54.

[9]陈火英，刘阳.番茄分子标记研究进展[J].上海交通大学学报，2003，21（4）：356-359.

[10]杨东娟,马瑞君.SSR分子标记在作物遗传多样性研究中的应用现状[J].甘肃科技，2007,23（8）：100-102.

[11]Tautz D.Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers[J].Nucleic Acids Resource,1989,7:6463-6471.

[12]刘杨,陈火英,魏毓棠.番茄微卫星标记(SSR)反应体系的优化研究[J].沈阳农业大学学报,2005,36(2):155-158.

[13]严长杰，徐辰武，裔传灯，等.利用SSR标记定位水稻糊化温度的QTLs[J].遗传学报，2001，28（11）：1006-1011.

[14]曾艳玲,谭晓风，曾晓峰.采用正交设计方法优化梨ISSR-PCR反应体系[J].湖北农业科学，2008,11（47）：1235-1237.

[15]何正文,刘运生，陈立华，等.正交设计直观分析法优化PCR反应条件[J].湖南医科大学学报，1998,23(4):403-404.

[16]许玉兰，蔡年辉，段安安，等.SSR-PCR反应体系建立与优化的研究概述[J].生物技术，2012,22（2）：73-76.

[17]梁玉琴，李芳东.正交设计优化柿属植物SSR-PCR反应体系[J].经济林研究，2012,29（4）：17-22.

[18]王珍,方宣钧.植物DNA分离[J].分子植物育种,2003,1(2):281-288.


相似文献/References:

[1]赵丹,林密,曲红云,等.保加利亚番茄新品种露地引种研究初报[J].黑龙江农业科学,2013,(02):77.
　ZHAO Dan,LIN Mi,QU Hong-yun,et al.The Introduction Experiment of Bulgaria New Tomato Varieties[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2013,(12):77.
[2]王 瑞.不同肥料配方对番茄复合基质育苗的影响[J].黑龙江农业科学,2012,(06):58.
　WANG Rui.Effect of Different Fertilizer on Tomato Breedingby Composite Matrix[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2012,(12):58.
[3]黄文,李自娟,应芳卿,等.不同施肥水平对番茄商品品质和产量的影响[J].黑龙江农业科学,2012,(11):48.
　HUANG Wen,LI Zi-juan,YING Fang-qing,et al.Effects of Different Fertilizer Application on Quality and Yield of Tomato[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2012,(12):48.
[4]朱建龙,杜岩,郭春勇,等.沼气发酵有机肥对番茄基质育苗效果的影响研究[J].黑龙江农业科学,2012,(11):50.
　ZHU Jian-long,DU Yan,GUO Chun-yong,et al.Study on the Effect of Biogas OrganicFertilizer on Tomato Seedling[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2012,(12):50.
[5]李帅,朱路路,张环宇,等.番茄白粉菌鉴定及番茄抗白粉病研究进展[J].黑龙江农业科学,2013,(04):147.
　LI Shuai,ZHU Lu-lu,ZHANG Huan-yu,et al.Progress in the Identification of Tomato Powdery Mildew Funguses and Disease Resistance Research[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2013,(12):147.
[6]孟庆英.番茄基因组DNA提取探讨[J].黑龙江农业科学,2011,(04):11.
　MENG Qing-ying.Study on Extraction of DNA from Tomato[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2011,(12):11.
[7]殷荷兰,秦公伟,徐 皓,等.番茄种子脂肪酸含量及组成比较分析[J].黑龙江农业科学,2012,(08):68.
　YIN He-lan,QIN Gong-wei,XU Hao,et al.Comparison of Fatty Acids Content and Its Composition[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2012,(12):68.
[8]周传余,郎英,周超.木醋液在番茄上的应用效果研究[J].黑龙江农业科学,2011,(03):47.
　ZHOU Chuan-yu,LANG Ying,ZHOU Chao.Study on Application Effects of Pyroligneous Liquid on Tomato[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2011,(12):47.
[9]周传余,郎 英,周 超.腐植酸复合肥对番茄产量和品质的影响[J].黑龙江农业科学,2011,(07):45.
　ZHOU Chuan-yu,LANG Ying,ZHOU Chao.Effects of the Humic Acid Compound Fertilizeron Yield and Quality of the Tomato[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2011,(12):45.
[10]查素娥,张春奇,李红波.马铃薯嫁接番茄试验初报[J].黑龙江农业科学,2010,(01):37.
　CHA Su-e,ZHANG Chun-qi,LI Hong-bo.Preliminary Report on Grafting Experiment of Tomato onto Potato[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2010,(12):37.

备注/Memo

基金项目：国家星火计划资助项目（2012GA850001-1）；西北农林科技大学校基本业务资助项目（2452013QN012）

第一作者简介：赵建涛（1990-），男，河南省周口市人，硕士，从事园艺作物品质调控及逆境调控机理研究。E-mail:zhaojiantao712100@163.com。
通讯作者：张静（1979-），女，博士，高级实验师，从事园艺植物生理及代谢研究。E-mail:yyzhj@nwsuaf.edu.cn。

更新日期/Last Update: 2014-12-24