LI Changzhou,ZHANG Cunjia,LI Haijie.Integrated Multi-Omics Analysis of Metabolite Synthesis and Gene Expression in Stems of Equisetum hyemale L.[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2025,(12):14-23.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2025.12.0014]
多组学联合分析木贼茎中代谢物的合成与基因表达
- Title:
- Integrated Multi-Omics Analysis of Metabolite Synthesis and Gene Expression in Stems of Equisetum hyemale L.
- 文章编号:
- 2
- Keywords:
- Equisetum hyemale L.; transcriptome; targeted metabolome; flavonoids
- 文献标志码:
- A
- 摘要:
- 为了探究木贼不同部位的基因表达和代谢物合成的差异,利用多组学联合分析(转录组、代谢组和靶向代谢组),揭示了木贼不同部位的差异基因表达,次生代谢物的合成和分布等,并分析了木贼不同部位的信号调控通路。结果显示,首先通过扫描电镜和能谱分析,发现木贼茎的表面覆盖有一层较厚的硅元素,另外,在木贼茎表面规律地分布有多排瘤状突起,而瘤状突起从外形看可以分为两类,一类是规则的圆形突起,一类是不规则的突起;通过元素扫描分析,两类突起都含有硅、钙、钠、铝等元素,硅含量最高(21.10%)。木贼茎组织中共检测并比对到175 944个转录本序列,KEGG分析表明,植物次生代谢物(Ko01060)的合成通路上的基因较为富集,其次是脂类代谢途径(ko00591)等;还统计了木贼转录组中常见的转录因子的数量和种类,发现了137个WRKY转录因子,106个bHLH转录因子,81个C2H2转录因子,94个MYB类转录因子;同时利用非靶向代谢组学检测到60种代谢物在M1(节间)样本中含量较高,39种代谢物在M1(节间)样本中含量相对较低,505种代谢物在两个样本中含量无差异;另外,靶向代谢组检测了木贼茎两个部位的35种类黄酮化合物的种类和含量,共鉴定出9种类黄酮化合物,其中4种绝对含量较高,分别为槲皮苷、对香豆酸(反式-4-羟基肉桂酸)、橙皮苷和金雀异黄酮& 芹菜素,M1(节间)样本中,金雀异黄酮 & 芹菜素化合物含量较高,为14.58 ng·g-1,而M2(节中)样本中,橙皮苷化合物含量较高,为3.44 ng·g-1,其余两种化合物槲皮苷和对香豆酸在M1(节间),M2(节中)样本中含量差别不大。综上,通过多组学分析,鉴定出木贼茎中差异代谢物99种,并鉴定出9种主要类黄酮化合物,及其合成途径的关键基因,能够为未来研究木贼茎中次生代谢物的合成奠定了基础。
相似文献/References:
[1]王猛.板栗新梢转录组测序及生物信息学基础分析[J].黑龙江农业科学,2018,(06):17.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2018.06.0017]
WANG Meng.Bioinformatic Analysis of Chinese Chestnut Transcriptome From Young Shoots[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2018,(12):17.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2018.06.0017]
[2]马忠才,Alison Kim Shan Wee.红树林植物逆境胁迫生理响应研究进展[J].黑龙江农业科学,2020,(05):111.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.05.0111]
[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2020,(12):111.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.05.0111]
[3]赵茜.南瓜干旱胁迫相关基因的转录组分析[J].黑龙江农业科学,2020,(10):25.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.10.0025]
ZHAO Qian.Transcriptome Analysis of Pumpkin Under Drought Stress[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2020,(12):25.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.10.0025]
[4]袁晓龙,张哲,张豪,等.转录组学在动物科学类专业生物信息学教学中的探索及实践[J].黑龙江农业科学,2020,(10):113.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.10.0117]
[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2020,(12):113.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.10.0117]
[5]袁晓龙,张哲,张豪,等.转录组学在动物科学类专业生物信息学教学中的探索及实践[J].黑龙江农业科学,2020,(10):117.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.10.0117]
[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2020,(12):117.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2020.10.0117]
[6]热米拉·阿帕儿,叶小芳,吕雪峰.转录组测序技术在毛色遗传学中的研究进展[J].黑龙江农业科学,2023,(12):142.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2023.12.0142]
Remila ·Apaer,YE Xiaofang,L Xuefeng.Research Progress on Transcriptome Sequencing Technology in Coat Color Genetics[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2023,(12):142.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2023.12.0142]
[7]冯英辉,俞金礼,刘金文.不同发育阶段红枫叶片呈色机制[J].黑龙江农业科学,2024,(05):63.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2024.05.0063]
FENG Yinghui,YU Jinli,LIU Jinwen.Mechanism of Leaf Color Change in Red Maple at Different Development Stages[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2024,(12):63.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2024.05.0063]
备注/Memo
收稿日期:2025-10-23
