MEN Longnan,LIU Lichao,WEI Zhonghua,et al.Genome-Wide Identification and Expression Analysis of KEA Gene Family in Rice[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2025,(12):1-13.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2025.12.0001]
水稻KEA基因家族全基因组鉴定和表达分析
- Title:
- Genome-Wide Identification and Expression Analysis of KEA Gene Family in Rice
- 文章编号:
- 1
- Keywords:
- KEA gene family; rice; phylogenetic analysis; synteny analysis; stress response
- 文献标志码:
- A
- 摘要:
- KEA(K+ Efflux Antiporter)基因家族隶属于CPA超家族,是植物中的K+转运体。KEA主要在植物的离子平衡和信号转导中起重要作用,但是其具体机制尚不清楚。为进行水稻KEA基因家族的全基因组分析,对8种不同科属的KEA基因进行了全基因组鉴定和系统发育分析。通过同源性搜索,在8个物种中鉴定出KEA基因家族的54个非冗余成员。系统发育聚类分析将KEA基因分为4个亚类,其中亚类IV为禾本科特有。保守基序、结构域和基因结构分析显示,OsKEA1、OsKEA2和OsKEA3的蛋白及基因结构更加相似,而OsKEA4、OsKEA5和OsKEA6的蛋白和基因结构更加相似。全基因组复制和串联复制是植物基因家族扩张的主要驱动力。通过KEA基因家族在物种间和物种内的共线性分析揭示了进化动力学,其中水稻与拟南芥之间未发现共线性基因对,而水稻与玉米之间存在7对共线性基因对。Ka/Ks值分析显示,水稻和玉米的KEA基因对经历了强烈的纯化选择,而OsKEA5和OsKEA6之间呈中性进化趋势。同时,检测了水稻KEA基因在干旱和盐胁迫中的表达,发现OsKEA5和OsKEA6在盐胁迫中表达上调,OsKEA2在干旱胁迫中表达上调,而OsKEA1、OsKEA3和OsKEA4在两种胁迫条件下表达下调。
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备注/Memo
收稿日期:2025-10-17
