[J].HEILONGJIANG AGRICULTURAL SCIENCES,2021,(02):17-22.[doi:10.11942/j.issn1002-2767.2021.02.0017]
灰葡萄孢基因组果胶酶生物信息学分析
- 文献标志码:
- A
- 摘要:
- 为有效防控果蔬灰霉病,本研究采用生物信息学方法对灰葡萄孢基因组内果胶酶的分布情况、理化性质及三级结构进行了分析。结果表明:灰葡萄孢基因组内检索出6条PG氨基酸序列,4条PME蛋白氨基酸序列和4个PEL家族蛋白。BcPG1~BcPG16蛋白序列长度为370~514 aa,信号肽长度在16~22 aa,磷酸化位点丰富;BcPME1~BcPME14蛋白序列长度为327~348 aa,信号肽长度在18~23 aa,都不存在N-糖基化位点,磷酸化位点多;BcPEL1~BcPEL4蛋白序列长度为 236~353 aa,信号肽长度在17~20 aa,存在多个O-糖基化位点,磷酸化位点多。3种果胶酶氨基酸序列分别存在保守区域,三级结构预测结果显示同一家族存在相似结构域,进化分析表明灰葡萄孢中的3种果胶酶具有保守性。
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备注/Memo
收稿日期:2020-11-05